Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTK2Q05397 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms