Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms