Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
GBE1Q04446 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms