Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
ERCC6Q03468 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms