Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms