Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHLH2Q02577 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms