Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC3AQ02505 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC3AQ02505 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms