Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG1Q02413 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG1Q02413 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms