Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms