Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms