Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms