Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYBPC1Q00872 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms