Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAMQ00059 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms