Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA4Q00056 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms