Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIM1P81133 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIM1P81133 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIM1P81133 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIM1P81133 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIM1P81133 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms