Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX3P78415 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX3P78415 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX3P78415 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX3P78415 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX3P78415 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX3P78415 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX3P78415 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX3P78415 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX3P78415 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX3P78415 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX3P78415 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX3P78415 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX3P78415 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX3P78415 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX3P78415 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX3P78415 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX3P78415 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX3P78415 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX3P78415 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX3P78415 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX3P78415 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX3P78415 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX3P78415 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX3P78415 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX3P78415 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX3P78415 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX3P78415 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX3P78415 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX3P78415 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX3P78415 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX3P78415 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX3P78415 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX3P78415 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX3P78415 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX3P78415 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX3P78415 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX3P78415 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX3P78415 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX3P78415 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX3P78415 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX3P78415 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX3P78415 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX3P78415 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX3P78415 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX3P78415 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX3P78415 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX3P78415 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX3P78415 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX3P78415 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX3P78415 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX3P78415 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX3P78415 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX3P78415 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX3P78415 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX3P78415 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX3P78415 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX3P78415 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX3P78415 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX3P78415 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms