Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBXN2AP68543 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms