Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL23P62829 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL23P62829 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL23P62829 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL23P62829 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL23P62829 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL23P62829 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL23P62829 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL23P62829 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL23P62829 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL23P62829 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL23P62829 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms