Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2HP62256 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2HP62256 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms