Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2FP61218 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms