Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLF3P57682 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF3P57682 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF3P57682 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF3P57682 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF3P57682 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF3P57682 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF3P57682 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF3P57682 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF3P57682 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF3P57682 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF3P57682 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF3P57682 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF3P57682 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF3P57682 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF3P57682 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF3P57682 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF3P57682 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms