Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2BFSP57053 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms