Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52P55327 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52P55327 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52P55327 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52P55327 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPD52P55327 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPD52P55327 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPD52P55327 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPD52P55327 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPD52P55327 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPD52P55327 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52P55327 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52P55327 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52P55327 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms