Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms