Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P54278 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P54278 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P54278 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P54278 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P54278 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P54278 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P54278 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P54278 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P54278 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P54278 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P54278 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P54278 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P54278 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P54278 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P54278 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P54278 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P54278 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P54278 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P54278 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P54278 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P54278 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P54278 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PMS2P54278 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P54278 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P54278 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P54278 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms