Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 C14orf2-203ENST00000553430 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.367e-7■■■■■ 29.2
SUB1P53999 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.487e-7■■■■■ 29.2
SUB1P53999 C14orf2-204ENST00000553449 271 ntTSL 25.6□□□□□ -1.517e-7■■■■■ 29.2
SUB1P53999 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.527e-7■■■■■ 29.2
SUB1P53999 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.677e-7■■■■■ 29.2
SUB1P53999 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.054e-10■■■■■ 29.2
SUB1P53999 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.384e-10■■■■■ 29.2
SUB1P53999 MRPS33-205ENST00000472343 788 ntTSL 29.85□□□□□ -0.837e-7■■■■■ 29.2
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SUB1P53999 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 29.2
SUB1P53999 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 29.2
SUB1P53999 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 29.2
SUB1P53999 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 29.1
SUB1P53999 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.431e-8■■■■■ 29.1
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SUB1P53999 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 29.1
SUB1P53999 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 29.1
SUB1P53999 PYCR2-206ENST00000478402 3149 ntTSL 211.56□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 29.1
SUB1P53999 GOT2-201ENST00000245206 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 29.1
SUB1P53999 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 29.1
SUB1P53999 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 29.1
SUB1P53999 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 29.1
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SUB1P53999 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.319e-7■■■■■ 29.1
SUB1P53999 NOLC1-208ENST00000603946 3217 ntTSL 1 (best)6.29□□□□□ -1.49e-7■■■■■ 29.1
SUB1P53999 NOLC1-201ENST00000370007 3727 ntTSL 1 (best)5.25□□□□□ -1.579e-7■■■■■ 29.1
SUB1P53999 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 29.1
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SUB1P53999 ANAPC5-214ENST00000539079 1715 ntTSL 1 (best)6.92□□□□□ -1.36e-11■■■■■ 29
SUB1P53999 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.456e-11■■■■■ 29
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SUB1P53999 LETMD1-222ENST00000550274 809 ntTSL 29.04□□□□□ -0.962e-21■■■■■ 29
SUB1P53999 EIF2B5-204ENST00000465218 1310 ntTSL 58.4□□□□□ -1.063e-11■■■■■ 29
SUB1P53999 LETMD1-217ENST00000548516 850 ntTSL 56.82□□□□□ -1.322e-21■■■■■ 29
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SUB1P53999 LETMD1-219ENST00000549395 475 ntTSL 35.03□□□□□ -1.62e-21■■■■■ 29
SUB1P53999 LETMD1-204ENST00000546814 894 ntTSL 24.84□□□□□ -1.632e-21■■■■■ 29
SUB1P53999 LETMD1-208ENST00000547256 618 ntTSL 24.42□□□□□ -1.72e-21■■■■■ 29
SUB1P53999 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 29
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SUB1P53999 CCT6A-204ENST00000466479 745 ntTSL 25.77□□□□□ -1.494e-7■■■■■ 29
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SUB1P53999 ENY2-214ENST00000522766 567 ntTSL 47.98□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 28.8
SUB1P53999 ENY2-202ENST00000517311 2966 ntTSL 27.88□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 28.8
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SUB1P53999 ENY2-208ENST00000520147 857 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.222e-8■■■■■ 28.8
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SUB1P53999 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.214e-11■■■■■ 28.8
SUB1P53999 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.764e-11■■■■■ 28.8
SUB1P53999 PPP2R2A-203ENST00000517754 2357 ntTSL 23.27□□□□□ -1.894e-11■■■■■ 28.8
SUB1P53999 SNHG5-204ENST00000425170 489 ntTSL 24.47□□□□□ -1.694e-12■■■■■ 28.8
SUB1P53999 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-15■■■■■ 28.8
SUB1P53999 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-15■■■■■ 28.8
SUB1P53999 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-15■■■■■ 28.8
SUB1P53999 JPT1-201ENST00000304834 1633 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.332e-15■■■■■ 28.8
SUB1P53999 JPT1-207ENST00000481094 382 ntTSL 511.11□□□□□ -0.632e-15■■■■■ 28.8
SUB1P53999 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.722e-15■■■■■ 28.8
SUB1P53999 JPT1-208ENST00000481647 576 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.862e-15■■■■■ 28.8
SUB1P53999 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.982e-15■■■■■ 28.8
SUB1P53999 SNRPD1-204ENST00000582475 723 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 28.8
SUB1P53999 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.252e-9■■■■■ 28.8
SUB1P53999 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 28.8
SUB1P53999 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 28.8
SUB1P53999 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 28.8
SUB1P53999 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 28.7
SUB1P53999 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.059e-7■■■■■ 28.7
SUB1P53999 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 28.7
SUB1P53999 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 28.79□□□□□ -12e-8■■■■■ 28.7
SUB1P53999 FECH-203ENST00000585494 1874 ntTSL 216.7■□□□□ 0.262e-22■■■■■ 28.7
SUB1P53999 EIF4A2-214ENST00000466362 545 ntTSL 22.37□□□□□ -2.037e-7■■■■■ 28.7
SUB1P53999 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.737e-12■■■■■ 28.6
SUB1P53999 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.027e-12■■■■■ 28.6
SUB1P53999 COX4I1-215ENST00000568339 2271 ntTSL 213.39□□□□□ -0.277e-12■■■■■ 28.6
SUB1P53999 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.657e-12■■■■■ 28.6
SUB1P53999 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.747e-12■■■■■ 28.6
SUB1P53999 COX4I1-206ENST00000564544 617 ntTSL 39.78□□□□□ -0.847e-12■■■■■ 28.6
SUB1P53999 COX4I1-207ENST00000564648 1235 ntTSL 56.9□□□□□ -1.37e-12■■■■■ 28.6
SUB1P53999 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.834e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 28.5
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