Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA8P53708 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms