Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LIMK1P53667 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMK1P53667 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms