Protein–RNA interactions for Protein: P53122

YGL138C, Uncharacterized protein YGL138C, yeast

Predictions only

Length 345 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL138C	P53122	PRS5	YOL061W	1491 nt		3.92	□□□□□ -1.78
YGL138C	P53122	PPE1	YHR075C	1203 nt		3.91	□□□□□ -1.78
YGL138C	P53122	REE1	YJL217W	597 nt		3.91	□□□□□ -1.78
YGL138C	P53122	YLR444C	YLR444C	303 nt		3.91	□□□□□ -1.78
YGL138C	P53122	YNR071C	YNR071C	1029 nt		3.91	□□□□□ -1.78
YGL138C	P53122	YBR137W	YBR137W	540 nt		3.91	□□□□□ -1.78
YGL138C	P53122	GEM1	YAL048C	1989 nt		3.91	□□□□□ -1.78
YGL138C	P53122	RNR1	YER070W	2667 nt		3.9	□□□□□ -1.78
YGL138C	P53122	SNF2	YOR290C	5112 nt		3.9	□□□□□ -1.78
YGL138C	P53122	TAF7	YMR227C	1773 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RRG1	YDR065W	1098 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RNH202	YDR279W	1053 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	YOS1	YER074W-A	258 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	YHI9	YHR029C	885 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	AIR1	YIL079C	1083 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	IRC25	YLR021W	540 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RPL22A	YLR061W	366 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	NIS1	YNL078W	1224 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	IST1	YNL265C	897 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RFC3	YNL290W	1023 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	MCM16	YPR046W	546 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	SPT6	YGR116W	4356 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	HAP4	YKL109W	1665 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	KTR6	YPL053C	1341 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	DHR2	YKL078W	2208 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	OSH3	YHR073W	2991 nt		3.9	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	YVC1	YOR087W	2028 nt		3.89	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RPS8B	YER102W	603 nt		3.89	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	BMT5	YIL096C	1011 nt		3.89	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	MTR2	YKL186C	555 nt		3.89	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	YLR042C	YLR042C	486 nt		3.89	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	USB1	YLR132C	873 nt		3.89	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RPS8A	YBL072C	603 nt		3.89	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	SUT2	YPR009W	807 nt		3.89	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	CHK1	YBR274W	1584 nt		3.89	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RAD4	YER162C	2265 nt		3.88	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RSF2	YJR127C	4143 nt		3.88	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RPA14	YDR156W	414 nt		3.88	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	BMH1	YER177W	804 nt		3.88	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	SDS3	YIL084C	984 nt		3.88	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	YML053C	YML053C	639 nt		3.88	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	YOR186W	YOR186W	435 nt		3.88	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	PUB1	YNL016W	1362 nt		3.88	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	VPS27	YNR006W	1869 nt		3.88	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	YOR022C	YOR022C	2148 nt		3.88	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RSC1	YGR056W	2787 nt		3.87	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	HCA4	YJL033W	2313 nt		3.87	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RRN11	YML043C	1524 nt		3.87	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	HAT2	YEL056W	1206 nt		3.87	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	CAB2	YIL083C	1098 nt		3.87	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	TIR2	YOR010C	756 nt		3.87	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	PNG1	YPL096W	1092 nt		3.87	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		3.87	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RRP14	YKL082C	1305 nt		3.87	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	PRP3	YDR473C	1410 nt		3.87	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	MCD4	YKL165C	2760 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	SHQ1	YIL104C	1524 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	MNR2	YKL064W	2910 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RDI1	YDL135C	609 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	ATP5	YDR298C	639 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RSM25	YIL093C	795 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	IRC9	YJL142C	393 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	ECM4	YKR076W	1113 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RUF21	RUF21	707 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	EAF7	YNL136W	1278 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	MTH1	YDR277C	1302 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	YLR152C	YLR152C	1731 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	ULS1	YOR191W	4860 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	SER3	YER081W	1410 nt		3.86	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	GTT2	YLL060C	702 nt		3.85	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	IMP4	YNL075W	873 nt		3.85	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	YOR114W	YOR114W	885 nt		3.85	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	BAG7	YOR134W	1230 nt		3.85	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	IDH2	YOR136W	1110 nt		3.85	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	OXR1	YPL196W	822 nt		3.85	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	HIM1	YDR317W	1245 nt		3.84	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	POP8	YBL018C	402 nt		3.84	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	RPN8	YOR261C	1017 nt		3.84	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	HSH49	YOR319W	642 nt		3.84	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	UBS1	YBR165W	834 nt		3.84	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	CMK1	YFR014C	1341 nt		3.84	□□□□□ -1.79
YGL138C	P53122	ACA1	YER045C	1470 nt		3.84	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	SEG1	YMR086W	2883 nt		3.84	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	YTA7	YGR270W	4140 nt		3.84	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	ASI1	YMR119W	1875 nt		3.84	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	RPO31	YOR116C	4383 nt		3.83	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	ALA1	YOR335C	2877 nt		3.83	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	TAF1	YGR274C	3201 nt		3.83	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	ISC10	YER180C	804 nt		3.83	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	ATG16	YMR159C	453 nt		3.83	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	VAM3	YOR106W	852 nt		3.83	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	MGA1	YGR249W	1371 nt		3.83	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	DBP5	YOR046C	1449 nt		3.83	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	KIP3	YGL216W	2418 nt		3.82	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	NUG1	YER006W	1563 nt		3.82	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	PEP7	YDR323C	1548 nt		3.82	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	SAW1	YAL027W	786 nt		3.82	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	HOT13	YKL084W	351 nt		3.82	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	SRP40	YKR092C	1221 nt		3.82	□□□□□ -1.8
YGL138C	P53122	YLR311C	YLR311C	348 nt		3.82	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms