Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDST1P52848 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDST1P52848 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NDST1P52848 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDST1P52848 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDST1P52848 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDST1P52848 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDST1P52848 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NDST1P52848 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDST1P52848 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDST1P52848 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDST1P52848 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDST1P52848 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDST1P52848 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDST1P52848 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDST1P52848 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDST1P52848 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDST1P52848 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDST1P52848 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDST1P52848 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDST1P52848 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDST1P52848 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDST1P52848 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDST1P52848 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDST1P52848 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST1P52848 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST1P52848 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms