Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF143P52747 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms