Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms