Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LUMP51884 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LUMP51884 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LUMP51884 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LUMP51884 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LUMP51884 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LUMP51884 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LUMP51884 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LUMP51884 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LUMP51884 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LUMP51884 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LUMP51884 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LUMP51884 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LUMP51884 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LUMP51884 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LUMP51884 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LUMP51884 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LUMP51884 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LUMP51884 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LUMP51884 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LUMP51884 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms