Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRE11P49959 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRE11P49959 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRE11P49959 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRE11P49959 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRE11P49959 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRE11P49959 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRE11P49959 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRE11P49959 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRE11P49959 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRE11P49959 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MRE11P49959 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRE11P49959 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRE11P49959 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRE11P49959 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRE11P49959 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRE11P49959 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MRE11P49959 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRE11P49959 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRE11P49959 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MRE11P49959 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRE11P49959 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRE11P49959 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRE11P49959 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRE11P49959 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRE11P49959 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms