Protein–RNA interactions for Protein: P49746

THBS3, Thrombospondin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3P49746 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
THBS3P49746 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
THBS3P49746 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THBS3P49746 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THBS3P49746 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THBS3P49746 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
THBS3P49746 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
THBS3P49746 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
THBS3P49746 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
THBS3P49746 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
THBS3P49746 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
THBS3P49746 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms