Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP4P49662 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP4P49662 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP4P49662 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP4P49662 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP4P49662 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP4P49662 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP4P49662 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP4P49662 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP4P49662 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP4P49662 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP4P49662 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP4P49662 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP4P49662 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP4P49662 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP4P49662 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP4P49662 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP4P49662 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP4P49662 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP4P49662 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP4P49662 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP4P49662 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP4P49662 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP4P49662 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP4P49662 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP4P49662 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP4P49662 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP4P49662 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP4P49662 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP4P49662 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP4P49662 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms