Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRIM1P49642 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms