Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTAP49354 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTAP49354 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTAP49354 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTAP49354 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNTAP49354 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTAP49354 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTAP49354 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTAP49354 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTAP49354 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTAP49354 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTAP49354 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTAP49354 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTAP49354 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTAP49354 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTAP49354 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTAP49354 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTAP49354 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTAP49354 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTAP49354 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTAP49354 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTAP49354 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTAP49354 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTAP49354 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTAP49354 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTAP49354 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTAP49354 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTAP49354 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTAP49354 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTAP49354 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTAP49354 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTAP49354 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTAP49354 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTAP49354 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTAP49354 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTAP49354 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTAP49354 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTAP49354 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTAP49354 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms