Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPIAP49247 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPIAP49247 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPIAP49247 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPIAP49247 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPIAP49247 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPIAP49247 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPIAP49247 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPIAP49247 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPIAP49247 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPIAP49247 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPIAP49247 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPIAP49247 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPIAP49247 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPIAP49247 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPIAP49247 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPIAP49247 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPIAP49247 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPIAP49247 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPIAP49247 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPIAP49247 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPIAP49247 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPIAP49247 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPIAP49247 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPIAP49247 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms