Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT5P48643 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT5P48643 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT5P48643 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT5P48643 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT5P48643 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT5P48643 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT5P48643 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT5P48643 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT5P48643 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT5P48643 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT5P48643 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT5P48643 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCT5P48643 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCT5P48643 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCT5P48643 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT5P48643 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT5P48643 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT5P48643 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT5P48643 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT5P48643 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT5P48643 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT5P48643 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT5P48643 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT5P48643 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT5P48643 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT5P48643 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT5P48643 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT5P48643 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT5P48643 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT5P48643 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT5P48643 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT5P48643 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT5P48643 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT5P48643 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT5P48643 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT5P48643 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT5P48643 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT5P48643 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT5P48643 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT5P48643 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT5P48643 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT5P48643 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT5P48643 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms