Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD8P48556 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms