Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME1P48163 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME1P48163 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME1P48163 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME1P48163 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME1P48163 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME1P48163 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME1P48163 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME1P48163 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME1P48163 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME1P48163 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ME1P48163 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME1P48163 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME1P48163 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME1P48163 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME1P48163 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME1P48163 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME1P48163 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME1P48163 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME1P48163 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME1P48163 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME1P48163 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ME1P48163 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ME1P48163 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ME1P48163 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ME1P48163 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ME1P48163 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME1P48163 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms