Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT3P45378 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT3P45378 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms