Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGER3P43115 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms