Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PIK3CBP42338 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms