Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETV3P41162 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETV3P41162 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV3P41162 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV3P41162 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV3P41162 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV3P41162 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV3P41162 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV3P41162 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV3P41162 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV3P41162 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV3P41162 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV3P41162 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms