Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 TMA16YOR252W 537 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 PKH1YDR490C 2301 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 AGA1YNR044W 2178 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 SYT1YPR095C 3681 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 MTH1YDR277C 1302 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 DAP2YHR028C 2457 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 DPB4YDR121W 591 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 RPA14YDR156W 414 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YEL074WYEL074W 339 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YJR096WYJR096W 849 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 TMA19YKL056C 504 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 TIR2YOR010C 756 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 VPS28YPL065W 729 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 PRM15YMR278W 1869 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YEL025CYEL025C 3567 nt3.26□□□□□ -1.89
DDI1P40087 SUC2YIL162W 1599 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 PMS1YNL082W 2622 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 RPN1YHR027C 2982 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 SPT10YJL127C 1923 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 MEF1YLR069C 2286 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YLR177WYLR177W 1887 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 GRX6YDL010W 696 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YGR219WYGR219W 342 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 NDJ1YOL104C 1059 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 RIB5YBR256C 717 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 MIT1YEL007W 2001 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YVC1YOR087W 2028 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 CHA4YLR098C 1947 nt3.25□□□□□ -1.89
DDI1P40087 RRP5YMR229C 5190 nt3.24□□□□□ -1.89
DDI1P40087 MSA1YOR066W 1890 nt3.24□□□□□ -1.89
DDI1P40087 RPN2YIL075C 2838 nt3.24□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YFL040WYFL040W 1623 nt3.24□□□□□ -1.89
DDI1P40087 MSS2YDL107W 1056 nt3.24□□□□□ -1.89
DDI1P40087 FES1YBR101C 873 nt3.24□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YBR242WYBR242W 717 nt3.24□□□□□ -1.89
DDI1P40087 FAS1YKL182W 6156 nt3.24□□□□□ -1.89
DDI1P40087 SLM2YNL047C 1971 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 CPA2YJR109C 3357 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 KTR6YPL053C 1341 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 COP1YDL145C 3606 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YDR271CYDR271C 372 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 ERJ5YFR041C 888 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YGR149WYGR149W 1299 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 FUR1YHR128W 651 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 YKE4YIL023C 1041 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 RPS21AYKR057W 264 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 MCM1YMR043W 861 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 FRE4YNR060W 2160 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 ARG5,6YER069W 2592 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 DSL1YNL258C 2265 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 CAF130YGR134W 3369 nt3.23□□□□□ -1.89
DDI1P40087 MIC60YKR016W 1623 nt3.22□□□□□ -1.89
DDI1P40087 PWP2YCR057C 2772 nt3.22□□□□□ -1.89
DDI1P40087 ISM1YPL040C 3009 nt3.22□□□□□ -1.89
DDI1P40087 WBP1YEL002C 1293 nt3.22□□□□□ -1.89
DDI1P40087 UBC8YEL012W 657 nt3.22□□□□□ -1.89
DDI1P40087 PET130YJL023C 1044 nt3.22□□□□□ -1.89
DDI1P40087 PAF1YBR279W 1338 nt3.21□□□□□ -1.89
DDI1P40087 STU2YLR045C 2667 nt3.21□□□□□ -1.9
DDI1P40087 AAD3YCR107W 1092 nt3.21□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YGL082WYGL082W 1146 nt3.21□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt3.21□□□□□ -1.9
DDI1P40087 GYP6YJL044C 1377 nt3.21□□□□□ -1.9
DDI1P40087 DOA4YDR069C 2781 nt3.21□□□□□ -1.9
DDI1P40087 PDR12YPL058C 4536 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 PHO5YBR093C 1404 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 CUE3YGL110C 1875 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 MGR3YMR115W 1506 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YDL180WYDL180W 1644 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YNL013CYNL013C 378 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 RHO5YNL180C 996 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 RRG9YNL213C 645 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 UAF30YOR295W 687 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 SPS4YOR313C 1017 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 RET3YPL010W 570 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 USV1YPL230W 1176 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 CLG1YGL215W 1359 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 TPD3YAL016W 1908 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 FAR1YJL157C 2493 nt3.2□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YMR317WYMR317W 3423 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 OAF3YKR064W 2592 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 ENA2YDR039C 3276 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 ENA1YDR040C 3276 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 PSF1YDR013W 627 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 SHU2YDR078C 672 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YDR149CYDR149C 708 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 BUD16YEL029C 939 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YGL101WYGL101W 648 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 IGO2YHR132W-A 396 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 RPL17AYKL180W 555 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 MRPL20YKR085C 588 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 RPS11BYBR048W 471 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 HPA2YPR193C 471 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 PTM1YKL039W 1572 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 GCN1YGL195W 8019 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 RCY1YJL204C 2523 nt3.19□□□□□ -1.9
DDI1P40087 LCB5YLR260W 2064 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 ETP1YHL010C 1758 nt3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms