Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP12P39900 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP12P39900 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP12P39900 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP12P39900 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP12P39900 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP12P39900 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP12P39900 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP12P39900 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP12P39900 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP12P39900 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP12P39900 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP12P39900 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP12P39900 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP12P39900 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP12P39900 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP12P39900 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MMP12P39900 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP12P39900 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP12P39900 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP12P39900 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP12P39900 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms