Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP62P37198 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP62P37198 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms