Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJC1P36383 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJC1P36383 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJC1P36383 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJC1P36383 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJC1P36383 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJC1P36383 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJC1P36383 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJC1P36383 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJC1P36383 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJC1P36383 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJC1P36383 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJC1P36383 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJC1P36383 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJC1P36383 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJC1P36383 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJC1P36383 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJC1P36383 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJC1P36383 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJC1P36383 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJC1P36383 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJC1P36383 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJC1P36383 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJC1P36383 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJC1P36383 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJC1P36383 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJC1P36383 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJC1P36383 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJC1P36383 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJC1P36383 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJC1P36383 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJC1P36383 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms